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雙鍊DNBSEQ黑科技,還原最真實的全基因組甲基化

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DNA甲基化是重要的表觀遺傳學标記信息,獲得全基因組範圍内所有C位點的甲基化水平數據,對于表觀遺傳學的時空特異性研究具有重要意義。如何更快、更高效地獲取全基因組水平上準确的甲基化信息,也一直是表觀科研用戶的持續關注點。

針對這些需求,華大自主研發了雙鍊DNBSEQTM,以多快好省的方式獲取全基因組水平的甲基化信息。


文末有(促銷)驚喜!


01、GC偏向性小,基因組覆蓋度均一性高,還原最真實的甲基化水平

甲基化多發生在基因組上高CG富集區域(例如CpG島等),如果文庫有明顯的GC偏向性(文庫建庫片段多為高CG區域),會導緻測序結果的甲基化率非常不準确/偏高。而華大雙鍊環化的方式,可以降低橋式PCR指數型擴增的錯誤累計以及單鍊擴增結構不穩定造成的GC偏向,特别是在高GC富集區,幫助我們提高測序數據覆蓋均一性,還原最真實的全基因組甲基化水平

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圖1 華大BGISEQ平台文庫GC偏向明顯小于其他公司測序平台,特别是在高GC富集區,甲基化率更真實

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圖2 華大BGISEQ平台文庫gDNA正負鍊比例更接近1,整體基因組覆蓋均一性更好

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圖3 華大BGISEQ平台數據可靠,測序有效深度高,基因組覆蓋度更平均


02、測序質量更高,基因組比對率顯著提升5%

華大雙鍊環化DNB測序技術使用的是非橋式PCR擴增測序方式(橋式PCR:指數型擴增,PCR錯誤容易被累計),提高DNA的保真性,測序質量更高,基因組比對率顯著提升。

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圖4 華大BGISEQ平台基因組比對率顯著提升約5%,測序質量更好,有效測序數據量更多


03、有效數據多,duplicates降低超過10%

華大自主研發BGISEQ平台duplicates(測序得到了兩對或兩對以上的pair end reads同時比對到參考序列上相同的起始和結束位置)比率低,和常規方法相比,顯著降低超過10個百分點,同樣的測序量,多10%的有效數據。

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圖5 華大BGISEQ平台Dup rate顯著降低超10%,更高效的數據使用率


黑科技帶給我們的不僅僅是技術上的優化和領先,同樣帶來了成本上的降低:

Duplicate 比例低10%,基因組比對率高5%,同樣的測序數據量,多15%的高質量可利用數據。等于整體成本降低15%,測的越多,省的越多。

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搭配促銷活動,現華大自主平台WGBS周期縮短至常規項目35工作日完整交付,大樣品項目更有專門生産通道還等什麼?聯系我們,開啟表觀研究新方法,一起還原最真實的甲基化!


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